Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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