Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB1Q14028 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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