Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TUBA3CQ13748 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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TUBA3CQ13748 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TUBA3CQ13748 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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TUBA3CQ13748 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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TUBA3CQ13748 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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TUBA3CQ13748 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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TUBA3CQ13748 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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TUBA3CQ13748 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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