Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDH18Q13634 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDH18Q13634 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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