Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL4BQ13620 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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