Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MTMR3Q13615 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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