Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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NAE1Q13564 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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NAE1Q13564 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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NAE1Q13564 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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NAE1Q13564 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NAE1Q13564 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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NAE1Q13564 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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NAE1Q13564 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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NAE1Q13564 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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NAE1Q13564 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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NAE1Q13564 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NAE1Q13564 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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