Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.724e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 TAF1-205ENST00000437147 2295 ntTSL 1 (best)10.18□□□□□ -0.784e-10■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.224e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.234e-7■■■□□ 17.1
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PABPC4Q13310 AC107871.1-204ENST00000638026 2895 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.438e-9■■■□□ 17
PABPC4Q13310 RBM39-225ENST00000465158 825 ntTSL 27.69□□□□□ -1.182e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.444e-7■■■□□ 17
PABPC4Q13310 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.274e-7■■■□□ 17
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PABPC4Q13310 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.083e-6■■■□□ 17
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PABPC4Q13310 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.398e-11■■■□□ 17
PABPC4Q13310 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.412e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 UBIAD1-204ENST00000486588 831 ntTSL 516.73■□□□□ 0.272e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 UBIAD1-203ENST00000483738 1393 ntTSL 313.23□□□□□ -0.292e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.223e-10■■■□□ 17
PABPC4Q13310 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.653e-10■■■□□ 17
PABPC4Q13310 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.391e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.281e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.131e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 BABAM1-215ENST00000601232 690 ntTSL 519.67■□□□□ 0.741e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 BABAM1-210ENST00000598567 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.06■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 BABAM1-204ENST00000594247 1004 ntTSL 515.53■□□□□ 0.081e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 MAP3K11-202ENST00000524848 2139 ntTSL 221.78■■□□□ 1.084e-12■■■□□ 17
PABPC4Q13310 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.074e-12■■■□□ 17
PABPC4Q13310 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.364e-12■■■□□ 17
PABPC4Q13310 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.184e-12■■■□□ 17
PABPC4Q13310 CYB5R1-207ENST00000497655 3033 ntTSL 27.74□□□□□ -1.173e-6■■■□□ 17
PABPC4Q13310 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.82e-6■■■□□ 17
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