Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIGQ13278 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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