Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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