Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
STX4Q12846 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
STX4Q12846 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STX4Q12846 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STX4Q12846 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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