Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GTF3C1Q12789 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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GTF3C1Q12789 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GTF3C1Q12789 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF3C1Q12789 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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