Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF5Q12774 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF5Q12774 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
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