Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ABCC8Q09428 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ABCC8Q09428 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms