Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLGA3Q08378 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GOLGA3Q08378 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms