Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms