Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF11Q05519 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms