Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OC90Q02509 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OC90Q02509 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OC90Q02509 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OC90Q02509 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms