Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
B4GALNT1Q00973 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4GALNT1Q00973 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms