Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SORDQ00796 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SORDQ00796 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SORDQ00796 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SORDQ00796 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SORDQ00796 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SORDQ00796 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORDQ00796 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORDQ00796 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms