Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSF1Q00613 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms