Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2P78314 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2P78314 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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