Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UFM1P61960 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UFM1P61960 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UFM1P61960 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UFM1P61960 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UFM1P61960 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UFM1P61960 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms