Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EEFSECP57772 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EEFSECP57772 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms