Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARFIP1P53367 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms