Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARFIP2P53365 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms