Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARCN1P48444 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms