Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms