Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXD13P35453 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms