Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SPRR1AP35321 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SPRR1AP35321 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms