Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFNP31947 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFNP31947 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SFNP31947 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFNP31947 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms