Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASQ1P31415 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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CASQ1P31415 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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