Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASP1P29466 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASP1P29466 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms