Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMB4P28070 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms