Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COL8A2P25067 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms