Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRGP23470 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
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