Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HRCP23327 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HRCP23327 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HRCP23327 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HRCP23327 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HRCP23327 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HRCP23327 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HRCP23327 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HRCP23327 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms