Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF1BP20333 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms