Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2CP19387 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms