Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMC1P11047 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms