Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGPD2P0DJD1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGPD2P0DJD1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms