Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOC1P02654 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms