Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSD2O96028 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSD2O96028 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSD2O96028 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms