Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CBX7O95931 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX7O95931 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms