Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX58O95786 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX58O95786 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDX58O95786 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms