Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KIF4AO95239 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KIF4AO95239 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms