Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSO75390 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSO75390 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSO75390 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSO75390 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSO75390 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSO75390 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSO75390 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSO75390 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSO75390 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSO75390 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSO75390 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSO75390 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSO75390 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSO75390 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSO75390 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSO75390 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms