Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPSNAP2O75323 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms