Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP5O75197 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP5O75197 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP5O75197 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP5O75197 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP5O75197 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP5O75197 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP5O75197 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5O75197 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRP5O75197 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRP5O75197 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5O75197 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5O75197 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5O75197 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms