Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG13O75143 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG13O75143 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG13O75143 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG13O75143 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG13O75143 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG13O75143 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG13O75143 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATG13O75143 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATG13O75143 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATG13O75143 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATG13O75143 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms